Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMEM225Q6GV28 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TMEM225Q6GV28 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms