Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCAF6Q58WW2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms