Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms