Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms