Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms