Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP7Q16576 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms