Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CDH18Q13634 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CDH18Q13634 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CDH18Q13634 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CDH18Q13634 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CDH18Q13634 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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