Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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ATRQ13535 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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ATRQ13535 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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ATRQ13535 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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ATRQ13535 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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