Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLN3Q13286 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN3Q13286 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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