Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA1Q13131 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms