Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms