Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP1-1Q07627 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms