Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms