Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms