Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms