Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NME5P56597 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NME5P56597 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NME5P56597 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NME5P56597 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms