Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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