Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GBX2P52951 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GBX2P52951 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GBX2P52951 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GBX2P52951 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GBX2P52951 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GBX2P52951 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GBX2P52951 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GBX2P52951 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GBX2P52951 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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