Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2A2P52657 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms