Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSEN1P49768 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms