Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCAMP43121 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCAMP43121 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCAMP43121 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCAMP43121 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCAMP43121 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCAMP43121 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms