Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms