Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GGCXP38435 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms