Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TGFBR1P36897 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms