Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms