Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms