Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms