Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRP12270 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRP12270 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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