Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNAP12004 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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