Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms