Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTA1P02549 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTA1P02549 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTA1P02549 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTA1P02549 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPTA1P02549 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SPTA1P02549 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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