Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms