Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms