Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-1B6SEH8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms