Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF879B4DU55 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms