Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCP1A6NGW2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCP1A6NGW2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms