Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms