Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP11Q9Y3A2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP11Q9Y3A2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP11Q9Y3A2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP11Q9Y3A2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms