Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLCO3A1Q9UIG8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLCO3A1Q9UIG8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms