Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms