Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRBP1Q9P2E9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms