Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms