Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPJQ9HC77 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms