Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLMPQ9H6B4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms