Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NYXQ9GZU5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NYXQ9GZU5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms