Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDRT15Q96T59 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms