Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms