Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
JSRP1Q96MG2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.8 ms