Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms