Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms